O Abrigo de Alqueva é um abrigo artificial de morcegos, que foi construído em 1995, como medida de minimização de impactes pela construção da barragem de Alqueva e que procurou dar resposta ou alternativa a uma pequena colónia de morcegos, onde constavam 5 espécies, e que estava instalada em zona de obra.
Hoje o Abrigo de Alqueva é um dos mais importantes abrigos de morcegos da Europa e a mais recente monitorização dos morcegos deste abrigo revelou uma ocupação de cerca de 6 000 indivíduos de quatro espécies diferentes, todas elas com estatuto de conservação preocupante.